Pro vybrané úkoly jsou ustaveny odborné komise a neformální pracovní skupiny. Většinu z těchto poradních uskupení jmenuje děkan, některé komise také zřizuje akademický senát, vědecká rada, nebo vznikají ve spolupráci těchto orgánů.

1. Pedagogická komise
akademičtí pracovníci:

prof. MUDr. Andrea Burgetová, Ph.D. – předsedkyně

prof. MUDr. René Foltán, Ph.D.
doc. MUDr. Ondřej Naňka, Ph.D.
prof. MUDr. Tomáš Grus, Ph.D.
doc. MUDr. Tomáš Kučera, Ph.D.
doc. MUDr. Lukáš Zlatohlávek, Ph.D.
prof. MUDr. Štěpán Havránek, Ph.D.
MUDr. Jiří Beneš, Ph.D.
MUDr. Otakar Raška, Ph.D.
MUDr. Antonín Šípek, Ph.D.
MUDr. Martin Vejražka, Ph.D.
doc. MUDr. Mikuláš Mlček, Ph.D.
prof. PhDr. Michal Miovský, Ph.D.
prof. MUDr. Jaromír Mašata, CSc.
MUDr. Kristian Chrz
prof. MUDr. Michal Vrablík, Ph.D.
MUDr. Simona Arientová, Ph.D.
MUDr. Jana Tuková, Ph.D.

studenti:
Jakub Černý VL
Michal Mjartan ZL

2. Komise pro zubní lékařství
prof. MUDr. Jana Dušková, DrSc., MBA – předsedkyně

doc. MUDr. René Foltán, Ph.D.
doc. MUDr. Hana Hubálková, Ph.D.
as. MUDr. Ladislav Korábek, CSc.
doc. MUDr. Ivan Matouš Malbohan, CSc.
as. MUDr. Daniel Ott
as. MUDr. Edgar Oganessian, Ph.D.  

3. Komise pro hodnoceni výuky
MUDr. Martin Vejražka, Ph.D. – předseda

doc. MUDr. David Zemánek, Ph.D
MUDr. Martin Vejražka, Ph.D.
MUDr. Simona Arientová, Ph.D. MBA
Martin Miller
Michal Mjartan
doc. MUDr. Jan Bouček
Ph.D. RNDr. Čestmír Štuka Ph.D.
Adéla Horáková
Matěj Hnilica
Andrea Louise Arnold

4. Disciplinární komise
Akademičtí pracovníci:
prof. MUDr. Otomar Kittnar, CSc. – předseda

prof. MUDr. Ondřej Slanař, Ph.D.
prof. MUDr. Pavel Dundr, Ph.D.
prof. MUDr. Jan Malík, CSc. - náhradník
prof. PhDr. Michal Miovský, Ph.D. - náhradník

studenti:
Jan Gara
Matěj Škandera
Andrea Rashovska
František Průša - náhradník
Viktorie Malovcová - náhradník

Ediční komise 1. LF UK
MUDr. Kateřina Jandová, Ph.D.- předsedkyně

MUDr. Jan Bříza, CSc., MBA
MUDr. Lenka Fialová, CSc.
doc. MUDr. Štěpán Havránek, Ph.D.
Mgr. Marie Kalinová
prof. MUDr. Karel Smetana, DrSc.

6. Komise pro práci s pokusnými zvířaty
Mgr. Viktor Sýkora – předseda

Ing. Jana Bortelová
MVDr. Alena Černá
doc. Dr. Ing. Karel Holada
MUDr. Nikolina Kutinová Canová
prof. MUDr. Emanuel Nečas, DrSc.
RNDr. Petr Szabo, Ph.D.

7. Likvidační komise
Ing. Petr Bečvář – předseda

prof. MUDr. Otomar Kittnar, CSc., MBA
RNDr. Čestmír Štuka, MBA
Jana Pavlová

8. Náhradová komise
Mgr. Eva Podrazilová Jenčíková – předsedkyně

Bc. Aleš Filipi
Hana Slavíková
doc. MUDr. Dana Marešová, CSc.
prof. Dr. Ing. Tomáš Navrátil, Ph.D.

9. Ústřední inventarizační komise - jmenována od 1. 11. 2021
Mgr. Viktor Sýkora - předseda

prof. MUDr. Stanislav Štípek, DrSc.
Ing. Roman Karaš

10. Patentová komise
doc. Ing. Karel Hána, Ph.D. – předseda

Mgr. Eva Adlerová, Ph.D.
prof. MUDr. Karel Smetana, DrSc.
doc. MUDr. Petra Lišková, MD, Ph.D.

11. Komise pro e-learning
MUDr. Martin Vejražka, Ph.D. – předseda

RNDr. Čestmír Štuka, MBA
prof. MUDr. Stanislav Štípek, DrSc.

12. Etická rada
prof. MUDr. Jiří Raboch, DrSc. – předseda

prof. MUDr. Otomar Kittnar, CSc.
prof. MUDr. Jana Dušková, DrSc.
MUDr. Simona Arientová, Ph.D.
MUDr. MgA. Kateřina Rusinová, Ph.D.

Stanoviska Etické rady